离职时，综合工时制因公司原因导致的工时不足

不会扣工资。依据《劳动法》，用人单位不得非法克扣劳动者工资，离职时工时不足也不应扣工资。若被扣，则违反法律规定，可能引发劳动纠纷。
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不会扣。处理方式：1.与公司沟通，明确工时不足原因，要求按实际出勤支付工资；2.若公司拒绝，收集证据，如工时记录、工资条等；3.向劳动仲裁部门申请仲裁或向法院起诉，维护自身权益。
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常见处理方式为协商或起诉。首先尝试与公司协商解决，若协商无果，则可通过法律途径起诉维权，确保自身合法权益不受侵害。